Destiny wordt aangevallen door een groep drones terwijl het zijn power reserves aan het opladen is. Hierdoor moet een groot deel van de bemanning evacueren via de Stargate.
Wanneer de bemanning een groepje kolonisten probeert te verhuizen naar hun oorspronkelijke planeet merken ze een verlaten stad met daarin beeldmateriaal van hun alternatieve levens.
Destiny komt in contact met een kolonie waar mensen leven die beweren dat hun beschaving 2000 jaar geleden is ontstaan door de bemanning van de Destiny.
Homeworld Command probeert via een bondgenoot wiens planeet veel naquadria heeft om de Destiny te bereiken. Echter vermoeden ze dat de Lucian Alliance geïnflitreerd is.